A Pietrelcina Padre Pio trascorreva le giornate dividendosi tra le preghiere, le celebrazioni liturgiche, gli insegnamenti del catechismo ai bambini e la formazione dei chierichetti.Ciò che gli dava maggior gioia era la direzione spirituale che poteva esercitare anche per corrispondenza, arrivando ad avere una trentina di persone che avevano voluto affidarsi alla sua guida. In questo modo poteva trasmettere ad altre anime le gioie di cui il Signore aveva voluto gratificarlo.
Non furono poche le battaglie che Padre Pio dovette combattere contro le tentazioni del demonio e contro i tormenti spirituali che talora lo assalivano.Ecco le sue parole di quel periodo: " Il demonio più che mai infierisce contro la navicella del mio povero spirito.
Padre mio, non ne posso veramente più, sento tutte le mie forze abbandonarmi; la battaglia è veramente arrivata al suo ultimo stadio, da un momento all'altro mi sembra che sto per soffocare sotto le acque della tribolazione".